日前，國(guó)際學(xué)術(shù)雜志Gut 刊發(fā)了來(lái)自中國(guó)科學(xué)院北京生命科學(xué)研究院趙方慶團(tuán)隊(duì)題為Tracing the accumulation of in vivo human oral microbiota elucidates microbial community dynamics at the gateway to the GI tract 的短文。這是該團(tuán)隊(duì)繼2018年5月在此雜志上發(fā)表孕期健康塑造新生兒初始菌群的研究論文后，再次推出他們?cè)诳谇晃⑸锬ば纬裳芯糠矫娴?新成果。該論文得到了雜志主編的高度評(píng)價(jià)，認(rèn)為該工作揭示了口腔菌群從破壞到重建的完整過(guò)程。

 

*新研究發(fā)現(xiàn)大多數(shù)口腔細(xì)菌能在腸道定植，像類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、IBD和結(jié)直腸癌等患者腸道中富集的細(xì)菌很多來(lái)自口腔。而且，微生物由口腔沿著消化道異位定植是一個(gè)頻繁且連續(xù)的過(guò)程。這些研究不僅強(qiáng)化了口腔與腸道之間的聯(lián)系，也激發(fā)了關(guān)于疾病起源于口腔、腸道亦或兩者皆有的討論，也引起了人們對(duì)于口腔菌群、小生境及口腔健康維護(hù)的重視。不僅如此，將口腔菌群用于消化道或其它疾病的輔助診斷也具有潛在的應(yīng)用價(jià)值。流動(dòng)態(tài)的唾液和附著態(tài)的牙菌斑是口腔微生物的兩種基本儲(chǔ)存形式，從時(shí)間梯度上來(lái)探究它們的穩(wěn)定性和動(dòng)態(tài)變化，能夠更好地了解口腔菌群，以及判斷它們作為生物標(biāo)記物檢測(cè)疾病的可靠性?；诖?，趙方慶團(tuán)隊(duì)開展了該項(xiàng)研究，并獲得了相關(guān)的研究成果。

 

洗牙是臨床常見的牙菌斑清理手段，恰好為跟蹤口腔生物膜附著情況和菌群重建過(guò)程提供了便利。研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)對(duì)洗牙前后三個(gè)月間11個(gè)連續(xù)時(shí)間點(diǎn)內(nèi)的169個(gè)唾液和牙菌斑微生物組數(shù)據(jù)進(jìn)行深度挖掘分析，以確定因受到外力擾動(dòng)而崩解的口腔微生物膜恢復(fù)到初始狀態(tài)的時(shí)間以及口腔菌群作為標(biāo)志物是否具有足夠的穩(wěn)健性（如圖）。團(tuán)隊(duì)通過(guò)追蹤人體口腔菌群的聚集，觀察到它們?cè)谑艿狡茐暮笪⑸锒鄻有院腿郝浣Y(jié)構(gòu)會(huì)隨時(shí)間發(fā)生動(dòng)態(tài)變化；并發(fā)現(xiàn)在強(qiáng)烈干擾后的整個(gè)跟蹤周期中唾液菌群多樣性和結(jié)構(gòu)一直保持穩(wěn)定，而牙菌斑菌群*為混亂的時(shí)期是生物膜解離后7小時(shí)至3天。研究明確了生物膜發(fā)生、發(fā)展和成熟三個(gè)時(shí)期的準(zhǔn)確時(shí)間跨度，即從洗牙后菌群解構(gòu)，到1天后嚴(yán)重偏離原始狀態(tài)，再到3天后重建，及隨時(shí)間推移逐漸恢復(fù)到原始完整形態(tài)。研究還發(fā)現(xiàn)許多細(xì)菌在干預(yù)后很快恢復(fù)到*初水平，表明洗牙在早期會(huì)對(duì)控制牙菌斑產(chǎn)生一定作用，但并不能長(zhǎng)期抑制細(xì)菌及其形成生物膜的能力。他們的研究也指出在口腔生物膜重建過(guò)程中，微生物補(bǔ)充的主要方向是由唾液到牙菌斑。該研究為深入理解消化系統(tǒng)微生態(tài)及微生物傳播提供了新的證據(jù)，有助于評(píng)估口腔細(xì)菌是否適合作為疾病檢測(cè)的靶標(biāo)，或能促進(jìn)臨床非侵入性診斷技術(shù)的發(fā)展。

 

北京生科院副研究員王金鋒及博士生賈震、碩士生張冰為論文的并列**作者，趙方慶為通訊作者。該研究獲得國(guó)家自然科學(xué)基金優(yōu)秀青年項(xiàng)目、面上項(xiàng)目和中科院重點(diǎn)部署項(xiàng)目“微生物組計(jì)劃”的資助，并在樣品收集方面得到首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京友誼醫(yī)院的幫助。