2016/17年度9月底下旬前開秤的吐魯番、哈密和喀什、阿克蘇等地棉區的軋花廠以收購、加工絮棉為主，80%以上通過公路發運。棉花汽運出疆的優勢可以歸納為：一、裝運和到廠時間有保證，比較受原料庫存低、隨用隨買棉紡織廠的青睞；二、北疆和東疆汽運至內地監管庫、紗廠倉庫的費用只比鐵路運輸稍高50-100元/噸(包括鐵路運費、出入庫裝卸費、物流輔助服務、印花稅、保險費等等)；三、公路出疆利于買方采購并節約費用。鐵路運輸只能移庫至買方或銷售市場附近倉庫，對于新疆棉企而言又要支付出入庫裝卸、保險、倉儲等等費用，而買方提貨還需支付短倒費、保險費等，既增加成本又手續繁瑣。

2016/17年度新疆棉公路運輸或面臨一系列困難，鐵路運輸將成為大部分棉企、紡企的**選擇，因此不排除南疆阿克蘇、巴楚、庫爾勒等地區倉庫站臺出現“一個車皮難求”的現象，原因如下：其一、2016年8月19日，交通運輸部、工業和信息化部、公安部、質檢總局、工商總局五部委聯合出臺超限、超載認定標準，意味著2016/17年度開始新疆棉汽運出疆的運輸費用將大幅上漲。眾所周知，目前棉花出疆一輛車裝載量大多在152 0173 3840-170包左右，北疆公路運輸有一輛車一個批次的情況(186包)，但新年度開始，單車的裝載量將明顯下滑，很可能出現2個批次需要3輛車的情況，公路運輸成本或大幅上升。其二、2016年儲備棉輪出延期至9月底，用棉企業、中間商的對新棉的有效采購將推至10月下旬甚至11月份，“等米下鍋”的紡織廠比較少，而且一些貿易商大多有一定量的儲備棉庫存，也需要10-15天的消化過程，因此前期疆內新棉將以“入庫、觀望、移庫”為主。考慮到“快入庫、快公檢、快運輸、快銷售”的希望不大，因此棉花出疆并不趕時間，鐵路成為棉花出疆的重要選擇。其三、近日發改委、財政部等聯合發文“不入庫、未公檢的棉花不允許申報2016/17年度出疆補貼”，疆內一些試圖“搶開秤、快加工，快出售”的軋花廠陷入尷尬。河南、四川、貴州、湖北等地絮棉、民用棉企業大多要求從疆內棉花監管倉庫提貨。而且由于國儲棉輪出時間延長，地產棉也大量上市，客戶并不急于補充庫存，也傾向于采用鐵路出疆。