華中農(nóng)業(yè)大學(xué)嚴(yán)建兵教授團(tuán)隊近日在美國《交叉科學(xué)》雜志發(fā)表論文稱，他們歷時10年創(chuàng)建的玉米數(shù)據(jù)庫（ZEAMAP）第三版上線，除了國內(nèi)科學(xué)家外，國外科學(xué)家也可以利用這里的數(shù)據(jù)進(jìn)行玉米育種研究。該數(shù)據(jù)庫內(nèi)嵌了基因組“瀏覽器”和“搜索引擎”，從而實現(xiàn)了對相關(guān)組學(xué)生物大數(shù)據(jù)的高度集成、快速檢索和智能分析。

　　此前，我國玉米基礎(chǔ)研究取得了顯著成績，但在其研究材料和數(shù)據(jù)的共享平臺建設(shè)上有待加強(qiáng)。該數(shù)據(jù)庫的建立，不僅幫助用戶提升了對作物組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘的時間效率，更實現(xiàn)了多維組學(xué)大數(shù)據(jù)之間的聯(lián)系，在打通信息“孤島”上邁出有力一步。

　　玉米遺傳育種研究 離不開數(shù)據(jù)庫

　　嚴(yán)建兵介紹說：“遺傳育種過程中，常常需要引入玉米中沒有的基因，在內(nèi)部進(jìn)行不同的排列組合，把好的基因組合轉(zhuǎn)移到一個新的品種里面去，以此對玉米的某些性狀進(jìn)行改良?！?/p>

　　由于玉米是飼料的主要來源，人體需要的肉蛋奶主要靠它轉(zhuǎn)化而來，所以玉米在中國的需求一直在增加。玉米在我國農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中的分量也越來越重，種植面積和總產(chǎn)量都已超過了水稻和小麥，躍居**。玉米的重要程度不言而喻，它關(guān)乎國家的糧食安全。

　　ZEAMAP是嚴(yán)建兵團(tuán)隊在進(jìn)行玉米遺傳改良研究時收獲的一個“副產(chǎn)品”?！坝衩讓ｉT數(shù)據(jù)庫對于玉米研究來說就是一個戰(zhàn)略資源，我們必須自己做?！?010年一回國，嚴(yán)建兵決定一邊做育種研究一邊帶著團(tuán)隊建數(shù)據(jù)庫。

　　打造玉米多組學(xué)數(shù)據(jù)“搜索引擎”

　　其實，在ZEAMAP走向國際之前，我國科學(xué)家已經(jīng)在利用它進(jìn)行各種研究。山東農(nóng)業(yè)大學(xué)儲朝暉教授利用ZEAMAP數(shù)據(jù)庫進(jìn)行大數(shù)據(jù)挖掘，找到了一個抗玉米紋枯病的關(guān)鍵基因；中國農(nóng)業(yè)大學(xué)秦峰教授利用ZEAMAP數(shù)據(jù)庫，發(fā)表了一系列玉米抗旱方面的成果……“實際上，這個數(shù)據(jù)庫信息量還是很大的，只要你愿意去挖掘，就可以從中獲益?！眹?yán)建兵強(qiáng)調(diào)，該數(shù)據(jù)庫可以成為玉米育種研究工作者的一個重要工具。

　　華中農(nóng)業(yè)大學(xué)教授劉彬做了一個三大糧食作物基礎(chǔ)研究的國際比較，結(jié)果顯示，近10年來，我國玉米研究突飛猛進(jìn)，特別是近5年，我國玉米研究在高質(zhì)量期刊上發(fā)表論文的活躍程度在全球已排名第二，僅次于美國。據(jù)不完全統(tǒng)計，ZEAMAP數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)已被60多個國內(nèi)外實驗室所使用，ZEAMAP數(shù)據(jù)庫中的材料也已經(jīng)分發(fā)多達(dá)152 0173 3840余份，基于該數(shù)據(jù)庫發(fā)表的高水平文章已經(jīng)有數(shù)十篇。

　　ZEAMAP數(shù)據(jù)庫從**版到現(xiàn)在的第三版，打破過去我國玉米育種研究的“信息孤島”，實現(xiàn)玉米多組學(xué)數(shù)據(jù)“云端”集成檢索分析；ZEAMAP數(shù)據(jù)庫成功整合了來自同一玉米群體的基因組、轉(zhuǎn)錄組、表型組、代謝組、表觀基因組、調(diào)控組以及遺傳定位結(jié)果等多組學(xué)數(shù)據(jù)，構(gòu)建了一個玉米屬綜合數(shù)據(jù)庫。

　　目前，ZEAMAP收錄了4個玉米基因組和1個大芻草基因組，并對每個基因組中數(shù)萬個預(yù)測基因予以詳細(xì)的功能注釋。該數(shù)據(jù)庫還整合了玉米關(guān)聯(lián)群體507份自交系中數(shù)百萬遺傳變異的基因型信息，并整合了遺傳變異與數(shù)十種農(nóng)藝表型、數(shù)百種籽粒代謝產(chǎn)物以及上萬個基因表達(dá)量的遺傳定位結(jié)果。

　　改良育種強(qiáng)化營養(yǎng)

　　“從用戶角度來說，ZEAMAP*大降低了用戶對作物組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘的時間成本?！比A中農(nóng)業(yè)大學(xué)教授李林主要利用生物大數(shù)據(jù)進(jìn)行玉米株型建成分子機(jī)制研究。他指出，目前全球已有的幾乎都是單一組學(xué)大數(shù)據(jù)庫，ZEAMAP則在一定程度上實現(xiàn)了多維組學(xué)大數(shù)據(jù)之間的聯(lián)系，立足于完整反映遺傳信息的整個鏈條，超越了存儲層面的數(shù)據(jù)庫。

　　天然玉米的油脂含量只有4%。為了獲得高油玉米，美國育種專家用了100年將這一指標(biāo)提高到20%；20世紀(jì)80年代我國育種專家宋同明教授采用新的思路進(jìn)行遺傳改良獲得這一結(jié)果，只用了8—10年。這里面的科學(xué)原理是什么，誰都不清楚，而且科學(xué)界的爭論也很大。

　　2013年，嚴(yán)建兵團(tuán)隊利用ZEAMAP數(shù)據(jù)庫，在世界上首次提出，基因組水平上微效多基因的累加是油分長期改良的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。這篇發(fā)表在《自然遺傳學(xué)》雜志上的高引用論文，解決了專家們的這一紛爭。

　　沿用這一思路，嚴(yán)建兵團(tuán)隊再次采用ZEAMAP數(shù)據(jù)庫，將甜玉米的維生素E提高到17%以上，*高可達(dá)2.5倍。這一成果**在廣東進(jìn)行轉(zhuǎn)化，目前高維生素E甜玉米品種包攬廣東甜玉米的半壁江山，占據(jù)了全國甜玉米20%的市場。這一成果摘得2016年度國家科技發(fā)明二等獎。

　　嚴(yán)建兵還參與了一項“生物強(qiáng)化”計劃，為預(yù)防兒童夜盲癥，選育富含維生素A源的玉米新品種。ZEAMAP數(shù)據(jù)庫再次立功，通過選擇高維生素A源種質(zhì)材料，使玉米中的維生素A提高到8微克/克。