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鯉魚基因組計(jì)劃成果促進(jìn)水產(chǎn)育種產(chǎn)業(yè)化

作者:百檢網(wǎng) 時(shí)間:2021-12-28 來源:互聯(lián)網(wǎng)

  近日,“863”計(jì)劃“鯉魚等功能基因組資源開發(fā)及其數(shù)據(jù)庫與網(wǎng)站構(gòu)建”和“鯉生長等經(jīng)濟(jì)性狀的主效基因發(fā)掘及育種潛力評估”項(xiàng)目組對《中國科學(xué)報(bào)》透露,該課題目前已取得階段性研究成果,成功裝配獲得鯉魚基因組框架圖譜、基因組物理圖譜、高密度連鎖圖譜,并獲得鯉魚—斑馬魚比較基因組圖譜和資源數(shù)據(jù)庫。

  該項(xiàng)目是“鯉魚基因組計(jì)劃”的階段性成果。2009年底,“鯉魚基因組計(jì)劃”由中國水產(chǎn)科學(xué)研究院水產(chǎn)生物應(yīng)用基因組研究中心、黑龍江水產(chǎn)研究所聯(lián)合中國科學(xué)院北京基因組研究所啟動(dòng)。

  為基因組水平育種奠定基礎(chǔ)

  在采訪中,中國水產(chǎn)科學(xué)研究院水產(chǎn)生物應(yīng)用基因組研究中心主任、水產(chǎn)生物技術(shù)應(yīng)用領(lǐng)域首席科學(xué)家孫效文表示,研究人員從基因組資源挖掘的角度做了大量工作。這些工作將為實(shí)現(xiàn)經(jīng)濟(jì)性狀在基因組上的精確定位、解開鯉魚的經(jīng)濟(jì)性狀(生長速度、抗病能力等)和基因的復(fù)雜關(guān)系、實(shí)現(xiàn)性狀基因定位及雜種優(yōu)勢分析、利用和育種研究提供了平臺。

  目前基因測序裝配已經(jīng)完成,研究成果正在逐步應(yīng)用到育種當(dāng)中,相關(guān)開發(fā)軟件也已被同行認(rèn)可和應(yīng)用。

  據(jù)孫效文介紹,該成果從群體遺傳學(xué)應(yīng)用角度,實(shí)現(xiàn)了基礎(chǔ)研究與應(yīng)用研究的結(jié)合,為實(shí)現(xiàn)基因組水平的水產(chǎn)育種產(chǎn)業(yè)化奠定了基礎(chǔ)。

  將基因和性狀關(guān)系的研究結(jié)果應(yīng)用于育種研究,主要包括三個(gè)階段:一是基于親本間遺傳關(guān)系,避免近親交配為主要目標(biāo)的分子水平育種;二是基于經(jīng)濟(jì)性狀和基因之間相互關(guān)系,尤其是經(jīng)濟(jì)性狀的數(shù)量性狀位點(diǎn)研究結(jié)果和功能基因組研究結(jié)果進(jìn)行分子育種;三是基于全基因組信息的經(jīng)濟(jì)性狀與基因相互關(guān)系的分子育種,尤其是對重要經(jīng)濟(jì)性狀如品質(zhì)性狀(肌間刺、氨基酸代謝等)的關(guān)鍵基因及信號通路的研究結(jié)果,以及進(jìn)一步的群體基因組學(xué)研究結(jié)果。

  水產(chǎn)生物人才匱乏亟待重視

  談及中國水產(chǎn)行業(yè)未來的發(fā)展,孫效文說:“項(xiàng)目進(jìn)行中遇到的主要困難就是優(yōu)秀人才的流失和缺乏,這也是目前中國與歐美發(fā)達(dá)國家研究領(lǐng)域的主要差別,尤其是水產(chǎn)行業(yè)的基因組研究和生物信息學(xué)方面的人才,目前國內(nèi)仍處于*度缺乏的狀態(tài)。”

  美國相關(guān)研究開展較早,從事基因組研究的人才隊(duì)伍龐大,且人員流動(dòng)和交流相對容易和頻繁,只要有好的研究平臺和待遇,不難吸引到優(yōu)秀的人才,而我國基因組研究人才整體匱乏,由于體制和待遇等原因,能夠分流到水產(chǎn)生物基因組研究領(lǐng)域的人才則更加稀少。

  孫效文表示,中國水產(chǎn)生物的基因組研究也有自己的優(yōu)勢,比如中國的鯉魚養(yǎng)殖有幾千年的歷史,長期的自然分化和人工選育使得中國的鯉魚種質(zhì)資源豐富度為世界之*。

  中國水產(chǎn)業(yè)對基因組研究技術(shù)的需求度*高,尤其是淡水主要養(yǎng)殖魚類具有肌間刺、肉質(zhì)等品質(zhì)方面的不足,這些性狀的改良十分依賴相關(guān)的基因組研究結(jié)果。

  此外,中國水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)產(chǎn)量世界**,占全世界的70%,這種巨大的市場需求也是基因組研究快速發(fā)展的重要?jiǎng)恿Α?/p>

  目前,該項(xiàng)目正在集中力量,從基因組水平對優(yōu)良品種和優(yōu)良地理種群進(jìn)行種質(zhì)評估,以期在群體基因組水平上提供下一步分子育種所必需的實(shí)用性強(qiáng)的基因資源和標(biāo)記。

  同時(shí),研究人員也在對鯉品質(zhì)性狀(肌間刺、脂肪發(fā)生、氨基酸代謝與合成)的關(guān)鍵基因及信號通路進(jìn)行解析與闡述,以期在基因組水平上開展鯉的經(jīng)濟(jì)性狀全面家養(yǎng)化培育研究。

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