根據《驗收暫行管理辦法》第八條第二點：污染物排放不符合國家和地方相關標準、環境影響報告書（表）及其審批部門審批決定或者重點污染物排放總量控制指標要求的，不得出具驗收合格意見，目前，企業在驗收的時候遇到國家排污許可證上的污染物總量控制指標與環境影響報告書及審批部門審批決定的總量指標有出入，企業在驗收的時候污染物排放的總量控制指標應該以環評批復為準，還是以國家排污許可證上核定的總量指標為準？
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據廣東省生態環境廳回復，《排污許可管理辦法（試行）》第十七條規定，核發環保部門按照排污許可證申請與核發技術規范規定的行業重點污染物允許排放量核算方法，以及環境質量改善的要求，確定排污單位的許可排放量。對于本辦法實施前已有依法分解落實到本單位的重點污染物排放總量控制指標的排污單位，核發環保部門應當按照行業重點污染物允許排放量核算方法、環境質量改善要求和重點污染物排放總量控制指標，從嚴確定許可排放量。
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2015年1月1日及以后取得環境影響評價審批意見的排污單位，環境影響評價文件和審批意見確定的排放量嚴于按照本條**款、第二款確定的許可排放量的，核發環保部門應當根據環境影響評價文件和審批意見要求確定排污單位的許可排放量。地方人民政府依法制定的環境質量限期達標規劃、重污染天氣應對措施要求排污單位執行更加嚴格的重點污染物排放總量控制指標的，應當在排污許可證副本中規定。本辦法實施后，環境保護主管部門應當按照排污許可證規定的許可排放量，確定排污單位的重點污染物排放總量控制指標。
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