? ? 植物
病毒俗稱植物上的癌癥,其流行和爆發(fā)嚴(yán)重威脅著糧食生產(chǎn)和人類食品安全。據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),全世界每年因植物病毒病造成的農(nóng)業(yè)損失占糧食作物總產(chǎn)量10%。傳統(tǒng)的植物病毒檢測(cè)方法包括血清學(xué)檢測(cè)、電子顯微鏡觀察、指示植物接種、通過(guò)PCR或RT-PCR進(jìn)行的DNA擴(kuò)增、芯片雜交等,使用這些方法的一個(gè)重要前提是對(duì)植物病毒的基因組特性、血清學(xué)特性、生物學(xué)特性、理化特性等有預(yù)先的了解;而對(duì)于未知病毒的檢測(cè),這些方法就顯得束手無(wú)策。 ?
? ? RNA沉默是一種廣泛存在于植物體內(nèi)的防御機(jī)制,當(dāng)植物病毒入侵植物的時(shí)候,植物體內(nèi)會(huì)針對(duì)入侵病毒產(chǎn)生大量的特異小RNA分子,可以抑制病毒的進(jìn)一步危害。由于這些小RNA分子與入侵病毒是相匹配的,因此,如果能獲得這些特異小RNA分子序列,就可以鑒定出入侵病毒種類。
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? ? 基于植物RNA沉默原理, 北京 檢驗(yàn)檢疫局結(jié)合承擔(dān)的質(zhì)檢公益性行業(yè)科研專項(xiàng)“應(yīng)用siRNA深度大規(guī)模測(cè)序技術(shù)篩查檢疫性植物病毒方法研究”(編號(hào):201310068研究,在國(guó)內(nèi)口岸**開(kāi)展了應(yīng)用小RNA深度測(cè)序技術(shù)檢疫鑒定植物病毒的研究,該課題利用*新的高通量測(cè)序儀器,以我國(guó)重要檢疫性植物病毒作為研究對(duì)象,深入地研究了一些重要檢疫性植物病毒入侵機(jī)制,解決了深度測(cè)序技術(shù)檢測(cè)植物病毒流程中的一些關(guān)鍵性難題,建立了應(yīng)用小RNA深度測(cè)序技術(shù)檢疫鑒定植物病毒方法,具有高靈敏度,檢測(cè)未知病毒速度快的優(yōu)點(diǎn),并且建立了口岸應(yīng)用小RNA深度測(cè)序技術(shù)檢疫鑒定植物病毒操作規(guī)范。
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? ? 課題組應(yīng)用研究成果在國(guó)際上報(bào)道了4種新的植物病毒,暫命名為玉米黃花葉病毒、玉米相關(guān)的形影病毒、玉米相關(guān)的整體病毒和山核桃花葉相關(guān)病毒;在國(guó)內(nèi)首次發(fā)現(xiàn)了留尼旺玉米線條病毒云南分離物、葡萄灰皮諾病毒、葡萄砧木莖病變伴隨病毒3種植物病毒。北京局首次將小RNA高通量測(cè)序技術(shù)應(yīng)用于出入境植物繁殖材料的檢疫,從進(jìn)境的荷蘭郁金香種球中檢出檢疫性植物病毒-南芥菜花葉病毒,從來(lái)源于美國(guó)、泰國(guó)的瓠瓜中檢出檢疫性植物病毒-黃瓜綠斑駁病毒;另外,還在從國(guó)外入境的植物材料中檢出了我國(guó)沒(méi)有分布的4種植物病毒:甘薯彈狀病毒A、甘薯彈狀病毒B、大麗花潛隱類病毒和大麗花矮縮病毒。
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? ? 小RNA深度測(cè)序技術(shù)以其快速和靈敏的檢測(cè)特點(diǎn)成為植物病毒學(xué)研究的強(qiáng)有力工具,尤其是對(duì)于未知病毒和非目標(biāo)病毒的檢測(cè),是以往的檢測(cè)方法所不可替代的。雖然現(xiàn)在該方法在實(shí)際應(yīng)用過(guò)程中存在儀器成本偏高,要求技術(shù)水平高的問(wèn)題,但是,隨著科學(xué)研究的逐步深入,這些問(wèn)題會(huì)迎刃而解,該技術(shù)也將會(huì)取代其他的檢測(cè)技術(shù)而廣泛的應(yīng)用于口岸、大學(xué)和科研部門的病原微生物檢測(cè)和研究中。
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